I Congressi hanno la funzione di promuovere la conoscenza e l’amicizia tra i Soci, di portare all’esame e alla discussione questioni e tematiche culturali di particolare rilevanza e attualità. Sono indetti ogni due anni dal Consiglio Centrale che ne fissa località, date e tema. Possono parteciparvi tutti i Soci dei Panathlon Club. Il primo Congresso è stato realizzato a livello nazionale nel 1956 a Firenze sui seguenti temi: "Dilettantismo e professionismo"; "Impianti sportivi e loro funzione"; "Norme di prevenzione sanitaria". Per quanto riguarda il CONGRESSO PANAMERICANO, lo stesso è nato per consentire al continente americano una maggiore responsabilità dinnanzi al contesto mondiale ed alla presa di coscienza di quanto abbia realizzato a favore della causa panathletica
